《死亡之谜》讲述了一名叫做何宁的心理医生，在收到一个来历不明的包裹以后，发现里面装着一块神秘的双鱼玉佩，由此经历了一系列光怪陆离的恐怖事件。他的妻子在自己面前跳楼以后踪迹全无，但是过一段时间，又突然出现在自己的眼前；何宁的女病患在702房间毫无征兆地上吊自杀；自己的心理医生神秘兮兮，神出鬼没；好友凌志杰一反常态，对自己的表现忽冷忽热等。何宁发现自己陷入了一个平行时空当中，这个世界是不断循环的，只要自己一刻不从中挣脱出来，他就会一直陷入这样的境地，为了寻求破局之法，何宁决定孤身探险，找到破解迷局的关键

《死亡之谜》围绕民间传说双鱼玉佩展开，以大众所熟知的故事为参照物，并由此展开一个个诡谲离奇的故事，这些故事全部围绕双鱼玉佩展开，这也是整部电影的关键。