电影《钢之炼金术师完结篇复仇者斯卡》承接了原作的精彩剧情，继续讲述了炼金术师爱德华·艾尔里克（Edward Elric）和他的弟弟阿尔冯斯·艾尔里克（Alphonse Elric）的冒险故事。这一次，他们将面对一个神秘的威胁，一个目标是国家炼金术师的神秘人物。

故事开始，一位神秘的人物开始以某种方式针对国家炼金术师，指责他们犯下了亵渎上帝的罪行。这个威胁不仅让炼金术师们感到震惊，也让爱德华和阿尔冯斯感到自己的脆弱。他们深陷于这场神秘势力的威胁之下，不得不面对自己过去的行为和决定。

与此同时，那些曾经的敌人——人造人（homunculi）再次出现在故事中。这一次的冒险将不仅考验爱德华和阿尔冯斯的能力，还将挑战他们的信念和情感。