剧集讲述了经典传奇人物亚瑟王年轻时的故事。在梅林成为驯龙者后的一年，乌瑟派遣亚瑟率领军队搜寻莫佳娜的下落，并将她带回卡美洛王国。然而，此时的莫佳娜已经不再是从前的莫佳娜，她已经是卡美洛王国内安插的奸细，企图削弱王国的核心势力并杀死乌瑟。莫佳娜的邪恶计划屡次被梅林阻止，成为梅林的对手

在一次偶然的事故中，莫佳娜得知了她实际上是乌瑟的亲生女儿，有权推翻乌瑟并继承卡美洛王国的王位。在姐姐莫高斯的帮助下，莫佳娜利用各种手段企图陷害亚瑟等人，将王国的未来推向水深火热之中。

《梅林传奇 第三季》展现了一幅权谋与争斗的传奇之旅。亚瑟王的成长和领导能力将受到考验，梅林的魔法将扮演关键的角色。而莫佳娜的身份秘密和邪恶计划也将令整个故事充满戏剧性和紧张感。